Ers gwneud ei ymddangosiad cyntaf gyda’r Scarlets yn 2006-07, mae ‘Foxy’ wedi sefydlu ei hun fel un o’r prif ganolwyr ym myd rygbi’r byd. Yn enillydd tair-amser y Chwe Gwlad gyda Chymru, roedd Jonathan yn rhan o ochr Prawf Llewod Prydain ac Iwerddon yn 2013 a 2017, a enwyd gan ei gyd-chwaraewyr fel chwaraewr y gyfres y Llewod. Treuliodd ddau dymor gyda'r cewri o Ffrainc Clermont Auvergne, gan gyrraedd rownd derfynol Cwpan Ewrop gyda Les Jaunards. Dychwelodd i Barc y Scarlets yn 2016-17 ac roedd yn rhan annatod o ochr ennill teitl PRO12 y Scarlets. Yn gwella ar ôl anaf difrifol i'w ben-glin a godwyd yng Nghwpan Rygbi'r Byd 2019.